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TMT法蛋白质组定量鉴定

同量异序标签(Tandem Mass Tag, TMT)是基于质谱技术的蛋白质相对定量方法中非常常见的一种。TMT 标签的多重相对定量方法具有很多优势,包括整个实验周期更短、波动更小,样品通量更高,以及样品间定量数据的缺失更少等。标记氨基的 TMT10plex 与 TMTsixplex 反应试剂的化学结构相同但是前者在质量报告区域中可以提供更多的 13C 和 15N 同位素组合形式。对于某些组合间彼此仅相差一个中子的质量,需要高分辨率的分析仪器实现串联质谱谱图采集才能进行区分。


◆ 蛋白质组学标记定量分析的特点
技术优势
      平行比较2-10个样本;
      蛋白通量高,覆盖度高;
      可用于各种类型生物样本。
应用领域
      各种胁迫、生理、病理条件下细胞、组织样品中高通量蛋白表达谱分析
      各种物种的蛋白质组草图的构建


质谱鉴定实验流程


 TMT法蛋白质组定量检测原理示意图:
 

使用仪器
Thermo Scientific Q Exactive, Q Exactive HF
 
 
实验报告内容
1、差异蛋白结果(excel 列表);差异蛋白归类(GO和KEGG分析)。
2、完整的实验步骤、使用仪器、试剂来源、软件检索参数等。
 

样品要求

检测样品 样品 要求
细胞样品 细胞数量 >1×107
组织样品    动物植物组织 >10mg
蛋白质溶液               蛋白质总量>200μg,浓度>1μg/μl;说明裂解液成分,浓度信息等

 

预处理及运输注意事项

为保证高质量的技术服务结果,请您参照以下说明对实验样本进行处理和保存:
⊙蛋白质溶液:定量并计算总蛋白量,密封好管口,干冰包装寄送。

特别提醒:快递寄送样本运输过程中,可能晃动幅度会比较大,请做好基本运输防护措施。
注:在寄送样本时,请填写好样本登记表,随样本一同寄往本公司。
 
 
服务收费:

  1. 询价

 

  1. 实验周期:
样品数目 2-6 7-10 10个以上
实验周期 3 weeks 4 weeks 5 weeks

 


 
TMT法蛋白质组定量鉴定参考文献

Justin M. D., et al. (2016) Phosphoproteome Integration Reveals Patient-Specific Networks in Prostate Cancer. Cell, 166, 1041–1054

Murray et al (2012) Identification and Quantification of S- Nitrosylation by Cysteine Reactive Tandem Mass Tag Switch Assay, Mol Cell Proteomics, 11, M111.013441

Bantscheff, et al, (2011), Chemoproteomics profiling of HDAC inhibitors reveals selective targeting of HDAC complexes, Nature Biotechnology, 9 (3): 255-265

Beliveau et al, (2010), Raf-induced MMP9 disrupts tissue architecture of human breast cells in three-dimensional culture and is necessary for tumor growth in vivo. Genes Dev. 24: 2800-281

Graham M. West, et al. (2010) Quantitative proteomics approach for identifying protein–drug interactions in complex mixtures using protein stability measurements. PNAS, 107(20): 9078-9082

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